遗传流行病与基因组学研究中心

发布时间:2016-01-13  浏览次数:375

 

1、中心概况

遗传流行病与基因组学研究中心成立于2012年2月。中心以严重影响人类健康的复杂疾病(如骨质疏松症、自身免疫疾病等)为主要研究对象,运用遗传流行病学、基因组、生物信息学、计算机科学、系统生物学、分子与统计遗传学、蛋白质组学等学科的理论与方法,以发现疾病相关生物标志物,发展疾病风险模型,开发疾病早期预防与诊断的新型有效技术和手段为主要研究目标。

  

2、师资力量

目前研究中心有教授2名、副教授2名、讲师3名、助理实验师1名、博士研究生4人、硕士研究生9人。

人员构成

雷署丰博士、中心主任、特聘教授(博导)

邓飞艳博士、教授(博导)

张  垒博士、特聘副教授(硕导)

汤在祥博士、副教授

莫兴波博士、讲师

武龙飞博士、讲师

朱   虹硕士、讲师

陆   鑫硕士、助理实验师

  

3、主要的研究方向

(1)疾病生物标志物的筛选与应用

(2)疾病风险预测模型的构建与应用

(3)复杂疾病的生物信息学

  

4、博士、硕士研究生招生专业

流行病与卫生统计学

  

5、在研项目

项目名称

来源

经费

(万元)

批准年度

主持人

1

类风湿性关节炎相关miRNA的鉴定以及血浆miRNA标志物的筛选与评价研究

NSFC

面上项目

80

2014

  

雷署丰

2

启动子区域遗传多态性位点与骨质疏松关联机制研究

NSFC

面上项目

81

2012

雷署丰

3

苏州大学人才引进基金

苏州大学

400

2012

雷署丰

4

苏州大学人才引进基金

苏州大学

100

2012

邓飞艳

5

绝经后妇女骨质疏松性骨折相关蛋白的鉴定及其功能研究

NSFC

面上项目

70

2013

邓飞艳

6

老年男性骨质疏松症的标记蛋白鉴定及其功能研究

江苏省基金

20

2013

  

邓飞艳

7

成骨相关细胞中骨质疏松症标志蛋白的鉴定

NSFC

主任基金

10

2015

邓飞艳

8

定位骨质疏松症隐藏遗传力和致病突变的方法与应用研究

NSFC

面上项目

50

2015

张  垒

9

苏州大学人才引进基金

苏州大学

50

2014

张  垒

10

整合遗传高维数据的贝叶斯多水平疾病风险预测模型构建方法与应用研究

NSFC面上项目(小额)

25

2015

汤在祥

11

lncRNA在类风湿性关节炎中的调控网络及分子功能机制

NSFC

青年项目

25

2014

莫兴波

12

类风湿性关节炎全基因组甲基化调控网络及功能机制研究

NSFC

青年项目

23

2014

朱  虹

13

肌骨素介导的骨代谢调控机制及对骨质疏松性骨折的风险评估

NSFC

青年基金

18

2015

武龙飞

14

类风湿性关节炎相关的miRNA鉴定及其作用网络研究

江苏省基金

20

2015

武龙飞

  

6、科研成果自2012年成立以来以苏州大学为第一单位发表的SCI论文15篇)

1.Deng FY, Tan LJ, Shen H, Liu YJ, Liu YZ, Li J, Zhu XZ, Chen XD, Tian Q, Zhao M, Deng HW. SNP rs6265 regulates protein phosphorylation and osteoblast differentiation and influences BMD in humans. J Bone Miner Res. 2013 Dec;28(12):2498-507.

2.Deng FY, Dong SS, Xu XH, Liu YJ, Liu YZ, Shen H, Tian Q, Li J, Deng HW. Genome-wide association study identified UQCC locus for spine bone size in humans. Bone. 2013 Mar;53(1):129-33.

3.Deng FY, Lei SF*, Zhang YH, Zhang ZL, Guo YF. Functional relevance for associations between genetic variants and systemic lupus erythematosus. 2013 PLoS One. e53037.

4.Deng FY, Lei SF*, Zhang YH, Zhang ZL. Integrative analyses for detection of functional mechanisms underlying associations for rheumatoid arthritis. 2013. Journal of Rheumatology. 2013 Jul;40(7):1063-8.

5.Zhu H, Deng FY, Mo XB, Qiu YH, Lei SF*. Pharmacogenetics and pharmacogenomics for rheumatoid arthritis responsiveness to methotrexate treatment: The 2013 update. Pharmacogenomics. 2014 Mar; 15(4):551-566.

6.Lei SF, Deng FY. Identification of susceptibility genes for systemic lupus erythematosus with a genome-wide gene-based association study.  Scandinavian Journal of Rheumatology. 2014;43(5):426-7.

7.Qiu YH, Deng FY, Li MJ, Lei SF*. Identification of Novel Risk Genes Associated with Type 1 Diabetes Mellitus Using a Genome-wide Gene-Based Association Analysis. Journal of Diabetes Investigation, 2014; 5: 649–656.

8.Zhu XW, Deng FY, Lei SF*. Meta-Analysis of Atherogenic Index of Plasma and Other Lipid Parameters in Relation to Risk of Type 2 Diabetes Mellitus. Primary Diabetes Care. 2015; 9:60-67.

9.Lin X, Deng FY, Mo XB, Wu LF, Lei SF*.Functional Relevance for Multiple Sclerosis-associated Genetic Variants. Immunogenetics2015; 67:7-14.

10.Lin X, Deng FY, Lu X, Lei SF*. Gene-based genome-wide association study identified susceptibility genes for multiple sclerosis.J Clin Neurol. 2015 Oct;11(4):311-8.

11.Zhu XW, DengFY, Wu LF, Lu X, Lei SF*. Functional Mechanisms for Type 2 Diabetes-associated Genetic Variants.Journal of Diabetes and its Complications. 2015May-Jun;29(4):497-501.

12.Mo XB, Lu X, Zhang YH, Zhang ZL,Deng FY, Lei SF*.Gene-Based AssociationAnalysis IdentifiedNovel GenesAssociated withBone Mineral Density.PLoS One. 2015 Mar 26;10(3):e0121811

13.Qiu YH, Deng FY, Tang ZX, Jiang ZH*, Lei SF*.Functional relevance for type 1 diabetes mellitus-associated genetic variants by using integrative analyses.Hum Immunol. 2015 Sep 30

14.Wang L, Wu LF, Lu X, Mo XB, Tang ZX, Lei SF, Deng FY. Integrated Analyses of Gene Expression Profiles Digs out Common Markers for Rheumatic Diseases.PLoS One. 2015 Sep 9;10(9):e0137522.

15.Zhang H, Mo XB, Xu T, Bu XQ, Lei SF, Zhang YH. Novel Genes Affecting Blood Pressure Detected Via Gene-Based Association Analysis.G3 (Bethesda). 2015 Mar 26;5(6):1035-42.

  

  

7、实验空间和仪器设备

中心位于苏州大学医学部大楼401 楼,目前具有300 平米实验空间,已经建立了细胞分离与培养、蛋白样品制备、生物信息学分析、质谱分析、PCR、RT-PCR、荧光信号检测等多个实验技术平台。具备四个研究方向的研究所需仪器设备,主要有:国际先进的蛋白质组学分析技术-纳升级高效液相色谱与高分辨质谱联用仪器(nanoLC-LTQ orbitrap Elite ETD)、FACS Calibur 流式细胞分析仪,凝胶成像分析系统、ABI7900 荧光定量PCR、CO2 细胞培养箱(Forma 公司)两台和高标准细胞培养室两间、高性能服务器等。另外,还有其它研究仪器和实验设备,超低温(-80℃)冰箱、Thermo Scientific Heraeus 高速冷冻离心机、倒置显微镜、NanoDrop 2000超微量分光光度计等仪器设备。

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